Аптеки на УСН с 2025 года обязаны платить НДС, если годовая выручка превышает 60 млн рублей. Новые лимиты, ставки 5% и 7%, порядок отчётности — всё это требует внимания и точности. Рассказываем, как не ошибиться и избежать налоговых последствий.
Что нужно запомнить
- С 2025 г. аптеки на УСН с доходом выше 60 млн руб. обязаны платить НДС. До этой суммы сохраняется освобождение от налога.
- Ставки НДС зависят от дохода: 5% при выручке до 250 млн, 7% — до 450 млн. Свыше 450 млн — переход на общую систему. Также аптека может применять стандартные ставки 10% или 20%.
- Доход для определения порога считают по кассовому методу. Важно учитывать поступления со всех режимов — и по УСН, и по патенту, если он используется.
- После превышения лимита аптека обязана выставлять счета-фактуры, вести книги и отчитываться по НДС по установленным правилам.
- Если используется ставка 10% или 20%, можно применять вычет по входящему НДС. При ставках 5% и 7% вычет не положен.
- Декларация по НДС подаётся раз в квартал строго в электронном виде. В 2025 г. новые плательщики освобождены от штрафов за просрочку.
- При расчёте налога важно точно определить ставку и учесть возможный вычет. Ошибки могут привести к доначислениям и штрафам.
Что изменилось с 2025 года
До 2025 г. аптеки на упрощённой системе налогообложения (УСН) не платили НДС. Они не начисляли налог на реализуемые товары и не могли принять к вычету входной НДС от поставщиков. Это упрощало налоговый учёт и снижало нагрузку на бизнес.
С 01.01.2025 порядок изменился: аптеки на УСН обязаны платить НДС, если их доход за год превышает 60 млн руб. — Федеральный закон № 176-ФЗ от 12.07.2024.
Если выручка за предыдущий календарный год не превышает 60 млн руб., организация сохраняет освобождение от НДС. При превышении лимита в течение года обязанность платить налог возникает с первого числа месяца, следующего за месяцем превышения.
Какие лимиты и ставки действуют для аптек
Если годовой доход аптеки не превышает 60 млн руб., организация не платит НДС. Освобождение предоставляется автоматически. В этом случае:
- аптека не выставляет счета-фактуры с НДС;
- не ведёт книги покупок и продаж;
- не сдаёт декларации по НДС.
Если доход превышает 60 млн руб., но не достигает 250 млн руб., аптека уплачивает НДС по ставке 5%. Обязанность возникает с первого числа месяца, следующего за месяцем превышения порога.С этого момента необходимо выставлять счета-фактуры с НДС 5%, вести книги покупок и продаж и ежеквартально сдавать декларации по НДС.
При доходе от 250 до 450 млн руб. ставка НДС составляет 7%. Переход на новую ставку происходит с первого числа месяца, следующего за месяцем превышения порога. Обязанности по документообороту не меняются: счета-фактуры, книги, отчётность остаются обязательными.
Если доход превышает 450 млн руб., аптека теряет право на применение УСН. С начала следующего года она обязана перейти на общую систему налогообложения, платить НДС по стандартным ставкам (10% на лекарства и 20% на прочие товары) и налог на прибыль.
Пока сохраняется право на применение упрощёнки, аптека может выбирать, по каким ставкам работать:
- по пониженным 5% или 7% без вычета входного НДС;
- по общим 10% или 20% с вычетом входного НДС.
Выбранный режим закрепляется в учетной политике организации и применяется не менее трёх лет подряд — п.8 ст.164 НК РФ. Переход на общую ставку может быть выгоден, если закупки с входным НДС занимают значительную долю расходов.
Как определять доход для целей НДС
Доход для определения порога учитывают по кассовому методу. В расчёт включают только фактически полученные средства: поступления на расчётный счёт, в кассу, а также иное имущество или погашение задолженности — п. 1 ст. 346.17 НК РФ.
Учитывают все поступления от реализации товаров, работ или услуг, включая полученные авансы. Также в расчёт включают совокупную выручку от всех видов деятельности, даже если они облагаются по другим режимам:
- доходы по УСН (основной аптечный бизнес),
- доходы по патентной системе налогообложения (ПСН), если она применяется,
- доходы по другим системам, не освобождённым от налогообложения.
Например, индивидуальный предприниматель совмещает два режима: УСН (основная аптека) и ПСН (дополнительная торговая точка). С января по август 2025 г. он получил 38 млн руб. по УСН и 24 млн руб. по ПСН. Общий доход составил 62 млн руб.
Так как порог в 60 млн рублей превышен, с 01.08.2025 он начисляет НДС по общим или специальным ставкам. А также выставляет счета-фактуры с выделенным налогом, ведёт книгу покупок и продаж, сдаёт декларации по НДС.
Контролировать доход нужно ежемесячно. Превышение лимита даже в одном месяце влечёт налоговые последствия с начала следующего. Рекомендуется вести учёт поступлений в разрезе месяцев и анализировать динамику.
Чтобы не пропустить момент возникновения налоговой обязанности, можно работать в онлайн-бухгалтерии «Мое дело», которая:
- автоматически учитывает доходы по кассовому методу;
- отслеживает поступления по всем системам налогообложения, включая ПСН;
- присылает напоминания о приближении к лимиту и предстоящих платежах.
Такой подход снижает риск ошибок и помогает соблюдать налоговые нормы.
Как правильно выставлять счета-фактуры
Если аптека на УСН не имеет права на освобождение от НДС (например, когда доход превышает 60 млн руб.), она начинает выставлять счета-фактуры с выделенным НДС — п. 3 ст. 168 НК РФ.
Счёт-фактура оформляется не позднее пяти календарных дней с даты отгрузки товара или получения аванса. Документ заполняется по форме, утверждённой постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 № 1137.
В счёте-фактуре указывают:
- наименование и ИНН/КПП продавца и покупателя;
- наименование товара, единицу измерения, количество, цену без НДС, сумму без НДС;
- ставку и сумму НДС;
- итоговую сумму с НДС.
Для автоматизации выставления СФ работайте в специальных программах и онлайн-сервисах, чтобы избежать ошибок и ускорить оформление документов.
Не забудьте обучить новым требованиям сотрудников, которые отвечают за налоговый и бухгалтерский учёт. Или найдите опытных специалистов на аутсорсе. Это снизит риск ошибок и возможных штрафов.
Как правильно вести книги покупок и продаж
Аптеки на УСН, не имеющие права на освобождение от НДС, обязаны вести книгу продаж — вне зависимости от применяемой ставки налога. В книгу вносят:
- выставленные счета-фактуры при отгрузке товаров и получении авансов;
- данные о розничных продажах через кассу, которые можно отражать сводным документом за месяц или квартал.
Книгу продаж ведут в хронологическом порядке по форме, утверждённой постановлением Правительства РФ № 1137 от 26.12.2011. Она служит основой для расчёта налоговой базы и заполнения раздела 9 декларации по НДС.
Если аптека применяет общую ставку НДС (10% или 20%) с правом на вычет, необходимо вести книгу покупок. В неё вносят счета-фактуры от поставщиков, подтверждающие уплату НДС при приобретении товаров и услуг. Данные из книги покупок отражают в разделе 8 декларации по НДС.
Если применяется пониженная ставка (5% или 7%) без права на вычет, книгу покупок можно не вести.
За отсутствие книг штрафуют по ст. 120 НК РФ:
- 10 000 руб. — нарушение совершено в течение одного налогового периода;
- 30 000 руб. — при нарушении в течение двух и более налоговых периодов;
- 20% от неуплаченного налога, но не менее 40 000 руб. — нарушение привело к занижению налоговой базы.
За ошибки в книгах отдельных штрафов нет, но эти ошибки могут повлиять на правильность расчёта налога, что уже в свою очередь наказывается.
Регулярно проверяйте корректность заполнения книг. Храните все первичные документы, подтверждающие операции, отраженные в регистрах, в течение установленного срока. Эти данные используются при заполнении декларации по НДС. Отсутствие книг покупок и продаж может привести к ошибкам в отчётности и дополнительным проверкам со стороны налоговой службы.
Что нужно знать о работе с декларацией по НДС
С 1 квартала 2025 г. действует обновлённая форма декларации по НДС, утверждённая приказом ФНС № ЕД-7-3/989@ от 05.11.2024. В бланк добавили строки для отражения операций с пониженными ставками — 5% и 7%.
Если платите НДС, заполняйте следующие разделы:
- Титульный лист — сведения об организации или ИП;
- Раздел 1 — сумма НДС к уплате в бюджет;
- Раздел 3 — расчёт налоговой базы и суммы НДС по применяемым ставкам;
- Раздел 9 — сведения из книги продаж.
Если применяете общую ставку НДС и пользуетесь вычетом входного налога, заполняйте раздел 8 — данные из книги покупок.
Декларация по НДС подаётся ежеквартально, не позднее 25 числа месяца, следующего за отчётным кварталом. Например, за второй квартал 2025 года нужно представить до 25.07.2025.
Декларация подаётся исключительно в электронном виде через оператора ЭДО по телекоммуникационным каналам связи (ТКС). Сдача на бумаге или через личный кабинет налогоплательщика не допускается и считается не представленной.
В 2025 году аптеки на УСН, впервые ставшие плательщиками НДС, освобождены от штрафов за несвоевременную сдачу декларации — постановление Правительства РФ № 530 от 23.04.2025. Льгота действует в отношении нарушений, допущенных с 1 января по 31 декабря 2025 года.
Как правильно рассчитывать НДС к уплате
Рассмотрим порядок расчёта НДС к уплате на примерах. Представим, что ООО «ФармаЛайт» применяет УСН. В 2024 году доход превысил 60 млн. руб., и аптека стала плательщиком НДС с 2025 года. Выбрана уплата НДС с пониженной ставкой. Доход за 2025 г. составил 180 млн руб. — это в пределах от 60 до 250 млн руб. Поэтому применяется ставка НДС 5%.
Во 2 квартале выручка составила 47,25 млн руб. Сумма НДС к уплате: 47 250 000 × 5% ÷ 105% = 2 250 000 руб.
Компании на УСН с пониженными ставками (5% или 7%) не имеют права на вычет входного НДС. Налог уплачивается с полной суммы реализации.
Другой пример — со ставкой 20% и вычетом входного налога. ООО «Аптека 24» стала плательщиком НДС, т.к. доход за 2024 год превысил 60 млн. руб. В 2025 году руководство приняло решение о стандартной ставке 20% с применением вычетов.
Во 2 квартале выручка составила 150 млн руб. Входящий НДС по закупкам — 20 млн руб. Расчёт НДС:
- 150000 000 × 20% ÷ 120% = 25 000 000 руб.
- 25 000 000 − 20 000 000 = 5 000 000 руб. к уплате в бюджет.
Организации на общей системе налогообложения имеют право на вычет входного НДС, если расходы документально подтверждены и связаны с налогооблагаемой деятельностью.
